2.2日本乙型脑炎病毒的基因组结构（Sbailendra etal., 2008）
2.3猪伪狂犬病毒的基因组结构（Yeetal., 2015）
2.4TGEV、PEDV和PDCoV的基因组结构（Changhee Lee 2015）
2.5猪繁殖与呼吸道综合征病毒的基因组结构（Kappes et al., 2015）
2.6 猪口蹄疫的基因组结构
图. 猪口蹄疫病毒基因组结构（Carrillo,USA）
2.7猪圆环病毒2型病毒的基因组结构（Zhai et al., 2014）
2.8塞尼卡病毒的基因组结构（Hales etal., 2008）
2.9猪圆环病毒3型病毒的基因组结构（Palinski et al., 2016）
2.10非洲猪瘟病毒的基因组结构（Dixon et al., 2013）
三、我国主要的猪病毒病病原的基因型
3.1我国非洲猪瘟病毒主要分为三个亚群，每个亚群又分为不同的分支，不同分支在我国的流行情况如下图所示
图.不同CSFV基因型在我国的分布（Luoet al., 2014）
3.2目前JEV的GI基因型为亚洲的流行基因型，GV为新鉴定基因型
图. 基于全基因组的不同基因型的JEV（Zhenget al 2012）
3.32011变异的PRV导致全国PRV的大爆发，目前PRV主要分为经典一群和变异二群
Yeet al., 2015
3.4TGEV通常认为只有一种基因型，笔者前期在美国鉴定了一种新型的TGEV毒株
图1. 基于全基因组的TGEV的基因型分布
3.5人们习惯于用单一一种检测方法检测猪细小病毒，但是目前已经报道了7种猪细小病毒，因此需要更新检测方法
图. 基于NS1基因的猪细小病毒的分型，已经有7个型的PPV的报道(Palinski et al 2016）
3.6PEDV主要分为经典和变异毒株，但是每种类型毒株又有不同的分支，国内外的PEDV的流行情况也不相同
图1我国不同基因型PEDV的分布情况（Chenet al 2016）
3.7PCV2不断的发生变异，不断有新的基因型的报道，目前全球范围内的主导基因型是2d
图.临床中PCV2的不同基因型（Zhaiet al., 2014）
3.8 目前delta冠状病毒主要包含禽类的和猪的
图. Delta冠状病毒的遗传进化分析（Wanget al 2014）
3.9不同国家猪塞尼卡病毒的遗传进化关系
图. 不同国家猪塞尼卡病毒的遗传进化关系（Deet al 2017）
3.10不同国家FMDV的主要基因型
图. 不同国家FMDV的主要基因型（Knowles et al 2013）
3.11PRRSV主要分为欧洲型和美洲型，但是不同型内和间存在很多的重组和传播现象，如下图
图. 不同PRRSV毒株的全球分布情况和假设的不同大陆之间的传播情况（图改制于Ko et al., 2015）
3.12PCV3不同基因亚型的分类情况
图. PCV3不同基因亚型的分类情况（Li et al 2018）
3.13 ASFV基因型及地理分布
图. ASFV基因型及地理分布（INIA-CISA，2016）
作者：陈芳洲（375200480@qq.com）
审阅者：刘爱民博士（liuxx063@umn.edu）
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